军团病是一种罕见而严重的肺炎，是一种由军团菌引起的呼吸道感染。诊断LD最准确的方法之一是对患者下呼吸道的样本进行培养，但这些样本很难获得。此外，培养需要专门的培养基、培养时间和条件，这是许多实验室所缺乏的;因此，LD很可能未被充分诊断。本周，在美国微生物学会的期刊《临床微生物学杂志》上，来自奥尔巴尼纽约州卫生部的研究人员描述了一种成本效益高的方法，即使用全基因组测序来鉴定不需要培养的嗜肺杆菌。这组科学家说，这种方法可以用来更好地分析现有的标本，并能够更密切地监测LD的爆发，特别是在难以培养的地方或病例中。

　　她说，新方法不需要培养这种分离物。“我们只依赖于标本中的生物。”这种方法依赖于一种叫做RNA诱饵的技术。它从研究人员已经培养的已知生物体开始。“我们把它们切成小块，”Musser说，然后产生与这些物种相关的RNA。他们使用这些RNA链——诱饵——从未知标本中提取DNA，然后对其进行测序和确认。他们的方法被称为杂交捕获，已经被证明是有用的。美国历史上最致命的LD爆发之一发生在2015年，发生在纽约市南布朗克斯的一个低收入社区。这次疫情导致16人死亡，100多人住院。这项调查使包括Musser在内的研究人员认为，该地区一个特定冷却塔产生的气溶胶是其来源。然而，通过全基因组测序，并不是所有的病例都与罪魁祸首有明确的联系。在这篇新篇论文中，Musser和她的同事们对2015年疫情受害者的尸检样本(无法培养)进行了杂交捕获，并在某些情况下确定了疫情的来源。“(尸检)样本通常是最难培养的，所以有一种方法可以用来对这些样本进行测序是非常有用的，”纽约卫生部(New York Department of Health)的研究科学家、该论文的三位第一作者之一菲尔·韦伯(Phil Weeber)说。“我们希望能够利用这种新方法，而不必有培养的分离物，”Musser说。“我们只提取我们想要的信息。它真的给了我们一些以前没有的谜团。”在之前的工作中，Musser的团队使用杂交捕获技术来鉴定产生志贺毒素的大肠杆菌，使用粪便样本而不需要培养。她说，杂交捕获提供了一种改善传染病监测的方法。“我们正处于一个非常激动人心的时代，这些新的下一代测序方法，”Musser说，“我认为我们可以做更多的工作来更好地理解和利用许多方法，我们就越接近能够回答公共卫生调查中的许多问题。”