研究人员使用历史文献和社交媒体的文本分析来追踪疫霉的传播，这是爱尔兰马铃薯饥荒背后的植物病原体。这种方法提供了对病原体的历史和它所带来的持续挑战的见解，强调了文本分析在理解植物疾病中的价值。来源:SciTechDaily.com

　　文本分析揭示了对传播的新见解5种从它对爱尔兰马铃薯饥荒的历史影响到它的现代存在。这种方法提供了一种追踪和了解植物病原体的新方法。

　　北卡罗莱纳州立大学的研究人员对历史和现代文字进行了文本分析，以揭示有关植物病原体的影响和传播的更多信息，这种植物病原体现在被称为疫霉，它导致了19世纪40年代爱尔兰的马铃薯饥荒，并继续困扰着土豆和西红柿的育种者。

　　该研究将1843年至1845年的历史农场报告、新闻报道和美国专利局农业记录数字化后，检查了“马铃薯腐烂”和“马铃薯病”等关键词，以显示这种病原体在1845年在爱尔兰造成毁灭性饥荒之前是如何首先在美国东北部传播的。该研究还使用文本分析来跟踪社交媒体动态，以了解晚疫病在现代的传播。

　　来自历史文献的见解政府和社交媒体

　　根据研究人员的说法，文本分析有望成为帮助研究人员跟踪和可视化历史和当前植物病害的有用工具。

　　“我们回到了对美国马铃薯疾病爆发的原始描述，因为它们发生在1843年至1845年之间，在欧洲爆发之前，”北卡罗来纳州立大学威廉尼尔雷诺兹植物病理学杰出教授Jean Ristaino说，他是科学报告中描述该研究的一篇论文的通讯作者。“我们通过关键词搜索这些描述，通过这样做，我们能够使用文档中提到的位置坐标重新创建原始的爆发地图。

　　“我们还试图了解当时人们对这种疾病的看法以及它的来源。”

　　马铃薯叶片上的晚疫病病。来源:Jean Ristaino，北卡罗来纳州立大学

　　该分析记录了马铃薯晚疫病在纽约州、特拉华州、马萨诸塞州、新泽西州和宾夕法尼亚州这五个州发生的情况，然后在1843年至1845年间传播到美国东北部其他地区和加拿大。这种病原体后来在欧洲——尤其是爱尔兰——造成了严重破坏。

　　该论文还研究了2012年至2022年的推文，以了解更多关于感染杆菌现代传播的信息。他们在推特上挖掘了病原体的普通名称和科学名称，并能够定位病原体的来源。

　　里斯蒂诺说:“社交媒体挖掘很有趣，因为我们发现大多数谈论这种疾病的人都是发达国家的科学家，他们在推特(现在是X)上宣传自己的研究。”“同样有趣的是，许多年前出现这种疾病的州现在仍然存在这种疾病。”

　　发现与未来方向

　　该研究还使用谷歌Ngram搜索词揭示了一个令人惊讶的发现。研究人员在20世纪50年代的文献中发现了晚疫病的激增。深入研究文件中引用的相关学术文献，里斯蒂诺发现了二战后美国番茄大面积爆发晚疫病的证据。

　　里斯蒂诺说:“这可能是一种新的北美病原体菌株的出现，被称为U.S. 1，在那之后变得非常普遍。”

　　里斯蒂诺补充说，她和她的团队计划继续这类工作，并将分析工具扩展到其他植物病虫害。

　　参考:Ariel Saffer、Laura Tateosian、Amanda C. Saville、Yi-Peng Yang和Jean B . Ristaino撰写的“使用文本分析重建历史和现代马铃薯晚疫病爆发”，2024年2月15日，《科学报告》。DOI: 10.1038 / s41598 - 024 - 52870 - 2

　　共同作者Ariel Saffer, Laura Tateosian和Yi-Peng Yang是北卡罗来纳州地理空间分析中心的一部分。里斯蒂诺实验室的研究专家阿曼达·c·萨维尔(Amanda C. Saville)也是这篇论文的合著者。资金由三角进化医学中心种子基金提供;美国农业部NIFA项目，资助号2015-2370;国家科学基金会PIPP第一阶段资助号2022-1191。